我应该如何处理“package 'xxx' is not available (for R version xyz)”警告？

1.你不会拼写

首先要测试的是您是否正确拼写了包裹的名称？包名称在 R 中区分大小写。

2.您没有查看正确的存储库

接下来，您应该检查该软件包是否可用。类型

setRepositories()

另见?setRepositories。

要查看 R 将在哪些存储库中查找您的包，并可选择选择一些其他存储库。至少，您通常希望选择 CRAN，如果您使用 Windows，则选择 CRAN (extras)，如果您进行任何生物学分析，则选择 Bioc* 存储库。

要永久更改此设置，请将 setRepositories(ind = c(1:6, 8)) 之类的行添加到您的 Rprofile.site 文件中。

3. 包不在您选择的存储库中

使用返回所有可用的包

ap <- available.packages()

另见Names of R's available packages、?available.packages。

由于这是一个大矩阵，您可能希望使用数据查看器来检查它。或者，您可以通过对行名称进行测试来快速检查包是否可用。

View(ap)
"foobarbaz" %in% rownames(ap)

或者，可以在浏览器中查看 CRAN、CRAN (extras)、Bioconductor、R-forge、RForge 和 GitHub 的可用软件包列表。

与 CRAN 镜像交互时您可能会收到的另一个可能的警告消息是：

Warning: unable to access index for repository

这可能表明所选的 CRAN 存储库当前不可用。您可以使用 chooseCRANmirror() 选择不同的镜像并再次尝试安装。

软件包不可用的原因有多种。

4.你不想要一个包裹

也许你真的不想要一个包裹。对 a package and a library 或包和数据集之间的区别感到困惑是很常见的。

包是扩展 R 的材料的标准化集合，例如提供代码、数据或文档。库是 R 知道找到它可以使用的包的地方（目录）

要查看可用数据集，请键入

data()

5. R 或 Bioconductor 已过期

它可能依赖于更新版本的 R（或它导入/依赖的包之一）。看着

ap["foobarbaz", "Depends"]

并考虑将您的 R 安装更新到当前版本。在 Windows 上，这可以通过 installr 包轻松完成。

library(installr)
updateR()

（当然，您可能需要先install.packages("installr")。）

同样对于 Bioconductor 包，您可能需要更新您的 Bioconductor 安装。

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("BiocUpgrade")

6. 包裹已过期

它可能是 archived（如果它不再维护并且不再通过 R CMD check 测试）。

在这种情况下，您可以使用 install_version() 加载旧版本的包

library(remotes)
install_version("foobarbaz", "0.1.2")

另一种方法是从 GitHub CRAN 镜像安装。

library(remotes)
install_github("cran/foobarbaz")

7. 没有 Windows/OS X/Linux 二进制文件

由于需要 CRAN 没有的其他软件，它可能没有 Windows binary。此外，某些软件包只能通过某些或所有平台的源获得。在这种情况下，CRAN (extras) 存储库中可能有一个版本（请参阅上面的 setRepositories）。

如果包需要编译代码（例如 C、C++、FORTRAN），那么在 Windows 上安装 Rtools 或在 OS X 上安装 developer tools 随附的 XCode，并通过以下方式安装包的源版本：

install.packages("foobarbaz", type = "source")

# Or equivalently, for Bioconductor packages:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("foobarbaz", type = "source")

在 CRAN 上，您可以通过查看描述中的 NeedsCompilation 标志来判断是否需要特殊工具来从源代码构建包。

8. 包在 GitHub/Bitbucket/Gitorious

它可能在 GitHub/Bitbucket/Gitorious 上有一个存储库。这些软件包需要安装 remotes 软件包。

library(remotes)
install_github("packageauthor/foobarbaz")
install_bitbucket("packageauthor/foobarbaz")
install_gitorious("packageauthor/foobarbaz")

（与 installr 一样，您可能需要先 install.packages("remotes")。）

9.包没有源码版本

尽管您的包的二进制版本可用，但源版本不可用。您可以通过设置关闭此检查

options(install.packages.check.source = "no")

如 this SO answer by imanuelc 和 ?install.packages 的详细信息部分所述。

10. 包在非标准仓库

您的包位于非标准存储库中（例如 Rbbg）。假设它合理地符合 CRAN 标准，您仍然可以使用 install.packages 下载它；您只需指定存储库 URL。

install.packages("Rbbg", repos = "http://r.findata.org")

另一方面，RHIPE 不在类似 CRAN 的存储库中，并且有自己的 installation instructions。

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在最新的 R (3.2.3) 中有一个错误，有时会阻止它找到正确的包。解决方法是手动设置存储库：

install.packages("lubridate", dependencies=TRUE, repos='http://cran.rstudio.com/')

在 other question 中找到解决方案

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这个解决方案可能会破坏 R，但这是一个最简单的解决方案，它在 99% 的时间内都有效。

你需要做的只是：

install.packages('package-name',repos='http://cran.us.r-project.org')

正如作者在 here 上提到的

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某些版本的 R 和 libcurl 似乎存在问题。我在 Mac (R version 3.2.2) 和 Ubuntu (R version 3.0.2) 上遇到了同样的问题，在这两种情况下，只需在 install.packages 命令之前运行它即可解决

options(download.file.method = "wget")

该解决方案是由一位朋友提出的，但是，我无法在任何论坛中找到它，因此将此答案提交给其他人。

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访问 https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/。使用 Ctrl + F 找到要安装的包 点击包名 确定要安装的版本 打开 RStudio 键入 "install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/[包名]/[版本号].tar.gz", repos = NULL, type="source")"

在某些情况下，您需要预先安装几个包才能使用您要使用的包。

例如，我需要安装 7 个包（Sejong、hash、rJava、tau、RSQLite、devtools、stringr）来安装 KoNLP 包。

install.packages('Sejong')
install.packages('hash')
install.packages('rJava')
install.packages('tau')
install.packages('RSQLite')
install.packages('devtools')
install.packages('stringr')

library(Sejong)
library(hash)
library(rJava)
library(tau)
library(RSQLite)
library(devtools)
library(stringr)

install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/KoNLP/KoNLP_0.80.2.tar.gz", repos = NULL, type="source")
library(KoNLP)

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11. R（或其他依赖项）已过期，您不想更新它。

警告这并不是最佳实践。

下载包源。

导航到说明文件。

使用文本编辑器删除违规行，例如 Depends: R (>= 3.1.1)

从本地安装（即从DESCRIPTION的父目录）例如 install.packages("foo", type="source", repos=NULL)

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发生在我身上的一件事是我的 linux 发行版提供的 R 版本（Ubuntu 14.04 提供的 R 版本 3.0.2）对于 CRAN 上可用的最新版本的软件包来说太旧了（在我的例子中，plyr 版本1.8.3 截至今天）。解决方案是使用我的发行版的打包系统，而不是尝试从 R 安装（apt-get install r-cran-plyr 让我获得了 plyr 的 1.8.1 版）。也许我可以尝试使用 updateR() 更新 R，但我担心这样做会干扰我的发行版的包管理器。

编辑（2020 年 4 月 8 日）：我最近遇到了一个问题，据报道，在 CRAN 中的软件包更新后，我的 R 版本（3.6.3，Debian stretch 最新支持）不可用的软件包（XML）。这是非常出乎意料的，因为我之前已经成功安装过它（在相同版本的 R 和相同的操作系统上）。

出于某种原因，软件包仍然存在，但 install.packages 只查看更新（且不兼容）的版本。解决办法是找到兼容版本的网址，强制install.packages使用，如下：

install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/XML/XML_3.99-0.3.tar.gz", repos=NULL, type="source", ask=FALSE)

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这为我节省了很多时间来调试问题所在。在许多情况下只是过时的镜子。此函数可以使用 https://cran.rstudio.com/ 安装多个包及其依赖项：

packages <- function(pkg){
    new.pkg <- pkg[!(pkg %in% installed.packages()[, "Package"])]
    if (length(new.pkg))
        install.packages(new.pkg, dependencies = TRUE, repos='https://cran.rstudio.com/')
    sapply(pkg, require, character.only = TRUE)
}

packages(c("foo", "bar", "baz"))

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当我收到相同的警告时，这就是我最终可以在 R-3.4.1 中安装 psych 包的方法

1：谷歌搜索那个包。

2：手动下载，扩展名为 tar.gz

3：选择“包存档文件（.zip;.tar.gz）”选项在R中安装包

4：本地浏览到下载的地方点击安装

您可能会收到警告：依赖项 'xyz' 不适用于包，然后首先从存储库安装它们，然后执行步骤 3-4。

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从源代码安装 R 包时，我犯了忘记放 repos=NULL 的错误。在这种情况下，错误消息有点误导：package 'foobarbaz' is not available (for R version x.y.z)

问题不在于 R 的版本，而在于 repos 参数。我做了install.packages('path/to/source/code/of/foobarbaz', type='source', repos=NULL)，在这个场合对我有用。

希望这可以帮助某人。

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通过仔细遵循 instructions for installing R，我在 Ubuntu 上修复了此错误。这包括：

将 deb http://cran.utstat.utoronto.ca/bin/linux/ubuntu trusty/ 添加到我的 /etc/apt/sources.list 文件中 运行 sudo apt-get update 运行 sudo apt-get install r-base-dev

对于第 1 步，如果您愿意，您可以选择任何 CRAN 下载镜像来代替我的多伦多大学。

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我有同样的问题（在 Linux 上），可以通过更改代理设置来解决。如果您在代理服务器后面，请使用 R 中的 Sys.getenv("http_proxy") 检查配置。在我的 ~/.Renviron 中，我有以下几行（来自 https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200488488-Configuring-R-to-Use-an-HTTP-or-HTTPS-Proxy）导致问题：

http_proxy=https://proxy.dom.com:port
http_proxy_user=user:passwd

将其更改为

http_proxy="http://user:passwd@proxy.dom.com:port"

解决了这个问题。您可以对 https 执行相同的操作。

当我读到“package xxx is not available for r version-xyz”时，这不是第一个想法......

高温高压

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另一个原因+解决方案

尝试在我公司 HPC 上的 RStudio 中安装 pkgdown 时遇到此错误（“包 XXX 不适用于 R 版本 XXX”）。

事实证明，他们在 HPC 上拥有的 CRAN 快照来自 2018 年 1 月（将近 2 年），当时确实不存在 pkgdown。这旨在为外行用户控制软件包的来源，但作为开发人员，在大多数情况下，您可以通过以下方式进行更改：

## checking the specific repos you currently have
getOption("repos")

## updating your CRAN snapshot to a newer date
r <- getOption("repos")
r["newCRAN"] <- "https://cran.microsoft.com/snapshot/*2019-11-07*/"
options(repos = r)

## add newCRAN to repos you can use
setRepositories()

如果您知道自己在做什么，并且可能需要多个软件包，而这些软件包可能在您的系统的 CRAN 中不可用，则可以在您的项目 .Rprofile 中进行设置。

如果它只是一个包，也许只使用 install.packages("package name", repos = "a newer CRAN than your company's archaic CRAN snapshot")。

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我发现#6 包的细微变化与@Richie Cotton 的优秀解决方案相比已过时。

有时包维护者可能会显示它不支持的 R 版本差距。在这种情况下，您至少有两个选择：1) 将您的 R 版本升级到目标包已经支持的下一个版本，2) 从可与您的 R 版本一起使用的旧版本中安装最新版本。

一个具体的例子：用于数据挖掘的包 rattle 的最新 CRAN 版本 5.3.0 不支持 R 版本 3.4，因为它在包版本 5.2.0 (R >= 2.13.0) 和 5.3 之间有很大的更新.0 (R＞=3.5)。

在这种情况下，升级 R 安装的替代方法是已经提到的解决方案。如果您没有软件包 devtools（它包括软件包 remotes），请安装它，然后安装可在当前 R 中运行的特定版本。您可以在 CRAN 页面上查找特定软件包存档的信息.

library("devtools")
install_version("rattle", version = "5.2.0", repos = "http://cran.us.r-project.org")

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在我的情况下，解决方案是简单地升级 R。

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当我使用 bioconductor 作为源然后调用 biocLite 时，它几乎总是对我有用。例子：

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("preprocessCore")

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另一个小补充，在尝试使用 docker 映像 rocker/r-ver:3.1.0 测试旧 R 版本时

默认的 repos 设置是 MRAN，这无法获取很多包。该版本的 R 没有 https，因此，例如： install.packages("knitr", repos = "https://cran.rstudio.com") 似乎可以工作。

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如 here（法语）所述，当您在计算机上安装了两个版本的 R 时，可能会发生这种情况。卸载最旧的，然后再次尝试安装包！它对我来说很好。

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